Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tnfsfm13Q8BXS2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tnfsfm13Q8BXS2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tnfsfm13Q8BXS2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tnfsfm13Q8BXS2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tnfsfm13Q8BXS2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tnfsfm13Q8BXS2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tnfsfm13Q8BXS2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tnfsfm13Q8BXS2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tnfsfm13Q8BXS2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsfm13Q8BXS2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms