Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sall4Q8BX22 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall4Q8BX22 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms