Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube3dQ8BX13 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube3dQ8BX13 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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