Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmod1Q8BVA4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms