Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nup54Q8BTS4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nup54Q8BTS4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms