Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PcgF3Q8BTQ0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcgF3Q8BTQ0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms