Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gga3Q8BMI3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms