Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab3gap2Q8BMG7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab3gap2Q8BMG7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms