Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc2Q8BKV1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms