Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp1Q8BJQ2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp1Q8BJQ2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp1Q8BJQ2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp1Q8BJQ2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp1Q8BJQ2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Usp1Q8BJQ2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp1Q8BJQ2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Usp1Q8BJQ2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Usp1Q8BJQ2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp1Q8BJQ2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Usp1Q8BJQ2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp1Q8BJQ2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp1Q8BJQ2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp1Q8BJQ2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Usp1Q8BJQ2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp1Q8BJQ2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Usp1Q8BJQ2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp1Q8BJQ2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Usp1Q8BJQ2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp1Q8BJQ2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Usp1Q8BJQ2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Usp1Q8BJQ2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp1Q8BJQ2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Usp1Q8BJQ2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp1Q8BJQ2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp1Q8BJQ2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp1Q8BJQ2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp1Q8BJQ2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Usp1Q8BJQ2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp1Q8BJQ2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp1Q8BJQ2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp1Q8BJQ2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp1Q8BJQ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp1Q8BJQ2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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