Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcal1Q8BJL0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarcal1Q8BJL0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms