Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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