Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms