Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Trmt12Q8BG71 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt12Q8BG71 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms