Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmtc4Q8BG19 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmtc4Q8BG19 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms