Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl42Q8BFQ9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl42Q8BFQ9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms