Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srgap3Q812A2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms