Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Liat1Q810M6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Liat1Q810M6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms