Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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ChfrQ810L3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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ChfrQ810L3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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ChfrQ810L3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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ChfrQ810L3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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ChfrQ810L3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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ChfrQ810L3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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ChfrQ810L3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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ChfrQ810L3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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ChfrQ810L3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms