Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc27Q80YS5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Lrrc27Q80YS5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Lrrc27Q80YS5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Lrrc27Q80YS5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Lrrc27Q80YS5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Lrrc27Q80YS5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc27Q80YS5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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