Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8Q80YR6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms