Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Pcsk9Q80W65 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Pcsk9Q80W65 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pcsk9Q80W65 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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