Protein–RNA interactions for Protein: Q80V91

Dtx3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3Q80V91 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx3Q80V91 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx3Q80V91 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx3Q80V91 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx3Q80V91 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dtx3Q80V91 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms