Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ube3cQ80U95 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube3cQ80U95 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms