Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sgo2Q7TSY8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sgo2Q7TSY8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms