Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnkQ7TSL0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfnkQ7TSL0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfnkQ7TSL0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfnkQ7TSL0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IfnkQ7TSL0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfnkQ7TSL0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfnkQ7TSL0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfnkQ7TSL0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfnkQ7TSL0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfnkQ7TSL0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfnkQ7TSL0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfnkQ7TSL0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfnkQ7TSL0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnkQ7TSL0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms