Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dsg1bQ7TSF1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms