Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim17Q7TPM3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms