Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nphp3Q7TNH6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nphp3Q7TNH6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms