Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HhipQ7TN16 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HhipQ7TN16 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms