Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tigd3Q7TM95 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd3Q7TM95 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms