Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TwistnbQ78WZ7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TwistnbQ78WZ7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms