Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msrb2Q78J03 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms