Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps27Q6ZWU9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms