Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih3Q6ZWS4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnih3Q6ZWS4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms