Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPT1

Klhl9, Kelch-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl9Q6ZPT1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl9Q6ZPT1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl9Q6ZPT1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms