Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tfap2eQ6VUP9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms