Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ift172Q6VH22 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift172Q6VH22 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms