Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Timd4Q6U7R4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timd4Q6U7R4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms