Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shc4Q6S5L9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms