Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptx4Q6RUU0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptx4Q6RUU0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms