Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcaf3Q6QR59 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcaf3Q6QR59 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms