Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NfrkbQ6PIJ4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfrkbQ6PIJ4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms