Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf1cQ6PDZ2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms