Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttbk1Q6PCN3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ttbk1Q6PCN3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttbk1Q6PCN3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttbk1Q6PCN3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttbk1Q6PCN3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttbk1Q6PCN3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms