Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC061212Q6P8K3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms