Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PcnpQ6P8I4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnpQ6P8I4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms