Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tsen2Q6P7W5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen2Q6P7W5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms