Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh2Q6P6J4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh2Q6P6J4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh2Q6P6J4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh2Q6P6J4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh2Q6P6J4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh2Q6P6J4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh2Q6P6J4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh2Q6P6J4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh2Q6P6J4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh2Q6P6J4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkbh2Q6P6J4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkbh2Q6P6J4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkbh2Q6P6J4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh2Q6P6J4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms