Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2mQ6P6I6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2mQ6P6I6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms